三方协议实际工作时间不符，其有效性需结合劳动合同判断。依据《劳动合同法》，劳动合同应明确工作时间等重要条款，若实际工作时间与约定不符，视为违约，可能影响员工权益及公司管理秩序。
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处理此类问题，常见方式有协商、调解及仲裁。首先应与用人单位沟通协商；协商不成可申请劳动调解；仍无法解决则可提起劳动仲裁，依据《劳动合同法》维护自身权益。
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应三方协议时间不符问题。具体操作：1.核实劳动合同约定时间，与三方协议对比，确认不符情况；2.与用人单位沟通，要求调整或确认实际工作时间；3.若沟通无果，收集证据，向劳动仲裁委申请仲裁；4.根据仲裁结果，决定是否继续履行或解除协议。